A Secretaria Municipal de Educação está orientando as escolas a fazerem o seu Plano de Desenvolvimento da Escola (PDE), uma das políticas educacionais do Governo Federal, que verifica o que está bem e o que está faltando. Desta maneira se estabelecem metas e prazos a serem cumpridos, para que no final do ano, a escola tenha sucesso. O programa serve para que alguns aspectos sejam analisados, como: se as crianças estão aprendendo, se há muitas faltas, se os pais estão envolvidos com a aprendizagem de seus filhos ou não, se o ambiente da escola é agradável ou não, se os funcionários estão se empenhando, se o espaço físico atende as necessidades de todos, se os resultados desejados estão sendo alcançados, entre outros. São mais de 170 itens analisados. O Professor Gestor ou o Professor Coordenador é o responsável em se reunir com representantes de funcionários, professores e pais de alunos, para que ideias possam ser trocadas. Haverá um acompanhamento mês a mês para constatar se o resultado do que foi combinado foi atingido.

Inicialmente o Governo Federal indicou a necessidade do Programa para as escolas de 1º ao 5º ano, mas o material foi adaptado às creches e à pré-escola, assim todas as unidades escolares da Rede Municipal elaboram o PDE. Desde 2002 já havia a preocupação em avaliar a educação na cidade.

Indaiatuba teve 1º lugar no Índice de Desenvolvimento Humano - IDH, fato em que a Educação contribuiu muito e 3º lugar no Índice de Desenvolvimento da Educação Básica - IDEB da Região Metropolitana, com 5,6 pontos. O IDEB é calculado pela nota que os alunos da 4ª série têm nas Provas Brasil e que pode subir ou descer de acordo com a aprovação dos demais alunos da escola e com as taxas de frequência e desistência.